用甲基托布津或代森锰锌防治效果好。
西瓜枯萎病防治用5%菌毒消100-200倍液在移栽后缓苗期灌根，防治效果达50%以上，发现零星病株时，用10%双效灵水剂200倍液，或5%治萎灵水剂200倍液或70%敌克松可湿性粉剂1000-1500倍液，在植株根部及其附近浇灌，每株灌药液300毫升。
1、选用抗病品种，这是防治枯萎病常用的方法。2、实行轮作，最好与玉米、水稻等作物轮作。要选择地势较高，排灌方便的壤土或者沙瓤土种植西瓜。定植后要合理浇水，3、科学育苗4、生物防治5、化学防治。
1、采用硫酸铜500倍液灌根，每株200毫升；2、木霉菌溶液治疗效果也不错；3、腐霉利和霜霉威混配，灌根；
西瓜枯萎病常用防治药剂:恶霉灵+35%甲霜灵+枯草芽孢杆菌或30%精甲恶霉灵+10%春雷霉素。
