种子处理：播种前用40%多菌灵可湿性粉剂,或70%甲基硫菌灵可湿性粉剂,或50%稻瘟净乳油、40%异稻瘟净乳油浸种。田间喷药：2~3叶期发生苗瘟,用6%施稻灵防治1次。移栽时,用25%使百克乳油1500倍液或20三环唑乳油750倍液浸秧根3小时,可有效地预防稻瘟病。
使用化学药剂控制稻瘟病是最常见和最有效的方式，主要的药剂包括苯菌灵、三环唑、异丙硫脲和抗生素（如杀稻瘟菌素和春日霉素）。这些农药中含有植物活化剂、胆碱生物合成抑制剂和黑色素生物合成抑制剂，持续多年的使用表明，保留不同类别的化学物质以干扰稻瘟菌的抗性，对防治稻瘟病有很好的效果。
避免过量施用氮肥。对未发病或叶瘟发生较轻地块，可用咪鲜胺、三环唑类药剂进行田间喷雾，早期预防。治疗：对于叶瘟发生初期地块，当出现发病中心病株时，使用咪鲜胺类药剂喷雾。同时加应加强田间管理，增加通风透光性。
可根据水稻所处生育期采取2种解决方法：一是稻穗未到完熟期，叶片有20%保持绿色，这时要继续施药以控制病害扩散，而且必须先用强氧化剂先灭菌，然后用富士一号等进行后期保护。二是稻穗已经达到完全成熟，粒皮黄色，稻粒干硬，这种情况就不必采取防治措施，因为即使不防治也不会进行再侵染和扩展。
水稻稻瘟病的化学防治方法是指采用下述药物喷洒防治：所使用的药物是：75%三环唑可湿性粉剂每亩25-30g；或2%春雷霉素水剂每亩90g；或稻瘟灵乳油150毫升/亩。施药方法和时间为：喷洒,水稻破口至始穗期第1次用药,如雨水较多齐穗期第2次用药。
以预防为主，综合防治。选抗病品种，育苗时做好种子和床土消毒，苗期注意通风锻炼，保证苗壮，移栽时注意栽植密度，加强本田管理提高抗病性，预防稻瘟病发生也可以打药，时期以水稻个别出穗时为好，有的年份在8月中旬持续高温高湿湿，打第一次药，隔7天左右再打一次。一般用富士一号，三环唑，或克瘟散等。
加强肥、水管理科学管理肥、水，既可改善环境条件，控制病菌的繁殖和侵染，又可促使水稻健壮生长，提高抗病性，从而获得高产稳产。注意氮、磷、钾配合施用，基肥、有机肥和化肥配合使用，适当施用含硅酸的肥料（如草木灰、矿渣、窑灰钾肥等），做到施足钾肥，早施追肥，中期看苗、看田、看天巧用施肥技术。硅、镁肥混施，可促进硅酸的吸收，能较大幅度地降低发病率。绿肥埋青量要适当，适量施用石灰可促进其腐烂，中和酸性。冷浸田应注意增施磷肥。
该病重在预防(重点是稻穗颈瘟)，在水稻破口期(约抽穗前3天)用75%三环唑30克/亩防一次，5-7天后再用春雷霉素2-3克+嘧菌酯5-6克、稻瘟灵、或用咪鲜胺+春雷霉素等再加强防一次。这样一般就能取得较好的防效。如有必要在齐穗期再打一次(抽穗期遇阴雨或品种不抗病的要打)。如己发生稻瘟病，如是初期可用凯润、加收米打，能有较好的保产效果！
药剂防治：大田分蘖期开始每隔3天调查一次，主要查看植株上部三片叶，如发现发病中心或叶上急性型病斑，即应施药防治；预防穗瘟根据病情预报，以感病品种，多肥田为对象，掌握破口期分别抽穗时打药。施药种类和剂量，每亩用20%三环唑可湿性粉剂100克或75%三环唑50克或40%稻瘟灵（富士一号）、乳油60～70毫升兑水50～60千克常量喷雾，重病田喷药2次，间隔7～10天。
农业防治。因地制宜地选用抗病品种。秧田期以前彻底处理完病稻草，消灭越冬菌源。施足基肥，巧施追肥，灌水应以深水返青，浅水分蘖，晒田拔节和后期浅水为原则。增施硅肥可有效减轻发病。药剂防治，对种子进行处理；田间喷药。
