黑粉病为害症状穗期显症，病株不矮化，为害穗部，只侵染子房，形成一个坚实的冬孢子堆。一般全穗的籽粒都变成卵形的灰包，外膜较坚硬，不破裂或仅顶端稍裂开，内部充满黑粉。病粒受压后散出黑色粉状物，中间留有一短且直的中轴。
（1）叶片。幼苗叶片上常出现隆起的条斑，初为乳白色，后变为棕褐色，条斑的条数不等，长度可与叶片等长。（2）茎秆。抽穗后病穗有2种症状一是柱状，二是分枝状，田间表现柱状黑穗居多。部分黑穗只能半截抽出、半截留在苞叶内。（3）穗部。茎秆发病主要发生在穗柄上或叶鞘的苞叶上，生成瘤节状孢子堆，孢子堆内无丝，外具膜易破裂，散出黑粉。
