轮作，水旱轮作，土壤消毒。
棉花的枯萎病用乙蒜素灌根比较理想。
棉花枯萎病，堵塞维管束，一旦发生，很难防治，一般采取轮作，选用抗病品种。
轮作，控制田间湿度，土壤消毒杀菌，药剂预防。
一是选用抗病良种。二是培育壮苗，提高棉花的抗病能力。三是枯萎病发病高峰期，即6月中下旬现蕾期和8月份花铃期，每隔7～10天用药1次，连续用药3～4次。四是降雨或浇水后形成一次发病高峰，降雨或浇水后及时用药。五是选用50%多菌灵可湿性粉剂1000倍或70%甲基托布津800倍加腐殖酸类叶面肥混合喷施，控制病害的发展。
棉花枯萎病以但得病很难治好。
防治棉花枯萎病必须从施肥开始。
做好发病后的补救工作。①田间发现零星病株后，应立即拔除集中烧毁，并对病穴及其周围进行消毒。②严重地块可采用喷雾与灌根相结合的方法。用3％广枯灵水剂300—500倍液、或用12.5％治萎灵200—250倍液，加磷酸二氢钾、绿风95进行喷雾，5—7天喷1次，连喷3—4次。灌根，每株用药液50—100ml，可减轻危害，控制病害蔓延。未发病地块，应喷洒黄腐酸有机肥或绿风95、磷酸二氢钾等叶面肥，以提高棉株抗病力，减少发病，7—10天喷1次，连喷2—3次。
